技术需求
( 一 ) 用途
主要用于全基因组测序、转录组测序、微生物宏基因组测序,靶向测序、遗传病测序、肿瘤测序等。
( 二 ) 技术参数
1. 可通过电脑端操作也可直接通过触控屏操作设备。
2. 测序仪可进行一级分析,输出 FASTQ 原始文件及测序质量分析等测序信息。
3. 测序仪可满足未知感染宏基因组测序、分型及溯源等应用。
4. 支持自动单端测序和双端测序,配合光学检测技术。
5. 测序试剂预置,一键加液,测序清洗试剂一体化,自带清洗维护程序,测序结束后自动清洗设备。
★ 6. 测序仪采用双模设计,可根据实验需要选择单独、同时、滚动上样,单模块可提供≥ 80M 的 r eads 数,双模块合计可提供≥ 160M 的 r eads 数。
7. 测序仪主机单次开机检测最高数据通量≥ 80Gb 。
8. 测序仪主机操作系统及说明书语言:标配中文,测序仪主机操作系统中文和英文可选。
★ 9. 测序仪基于线性扩增技术,每次扩增都以原始 DNA 单链环为模板,有效避免 PCR 扩增错误指数积累。
10. 低标签跳跃:通过各项技术可有效降低标签跳跃,保证数据准确性。
★ 11. 读长支持:支持读长类型至少应包括 SE100 、 PE150 、 PE250 、 PE300 ,或更多类型。
12. 测序时长:读长 SE100 时测序时间≤ 5 小时,整机最高产出数据量≥ 16G ;读长 PE150 时测序时间≤ 12 小时,整机最高产出数据量≥ 48G 。
13. 数据质量:读长为 PE50 ,数据质量 Q30 > 90% ;读长为 PE150 ,数据质量 Q30 > 85% ;读长≥ PE250 ,数据质量 Q30 > 75% 。
14. 建库试剂方案完整,可提供与测序仪生产厂家同品牌的 DNA 、 RNA 文库制备试剂套装(建库试剂盒)同时支持开放试剂及耗材,并能提供现场技术支持(供应商须 在投标文件中 提供相应承诺函)。
★ 15. 配备自动化样本制备系统,内置扩增仪,配备≥ 96 通道移液器,单次运行支持≥ 96 个样本文库制备,内置紫外消毒系统及空气洁净系统,可自动化实现扩增及纯化等建库流程。
16. 自动化样本制备系统,支持移液体积范围 2 ul-200 ul 范围, 移液分辨率≤ 0.1ul 。加样精度: CV ≤ 5%(2 μ l 时 ) ,准确度: < ± 10% ; CV ≤ 1%(200 μ l 时 ) ,准确度: < ± 1% 。
★ 17. 配备外置本地化服务器,至少满足内存 192GB DDR4 ,固态硬盘 2TB+250GB ,机械硬盘 30TB 。服务器内置中文微生物快速识别软件、微生物组装溯源软件、新冠病毒分析软件,软件更新时可提供本地更新。
18. 微生物快速识别软件可进行宏转录组数据分析、宏基因组数据分析,以及 DNA/RNA 数据共分析,对原始样本中的微生物核酸序列进行分析和鉴定,并自动生成鉴定结果和分析报告。
19. 微生物快速识别软件内置物种数据库,包括 10 种以上的宿主物种,人、猪、山羊、绵羊、小鼠等;同时,支持定制化开发更多宿主物种。
20. 微生物快速识别软件收录不低于 2 万种微生物,涵盖细菌、真菌、病毒、寄生虫及古生菌等。
21. 微生物组装溯源软件,包含多个分析模块可对细菌、真菌、病毒等病原微生物的测序数据,实现从测序下机数据到基因组组装、系统进化分析,并自动计算变异检测结果供研究参考。
22. 新冠病毒分析软件,可进行多重 PCR 打断技术测序数据的分析。包含数据质控、组装、变异注释、分型、溯源功能,测序完成后可自动传输数据并分析。
★ 23. 配备中文遗传病测序、肿瘤测序分析软件,分析软件可进行遗传变异检测与分析,实现碱基质量分数校正、体细胞突变检测功能。
24. 遗传病测序、肿瘤测序分析软件具备质控功能,用于去除低质量序列、接头及杂质,可产生包含碱基质量分布、 GC 含量、接头污染等详尽指标的报告。具备序列比对功能,可将二代测序产生的 reads 高效映射到参考基因组上。
25. 遗传病测序、肿瘤测序分析软件具备注释变异的功能效应,结合数据库信息解析变异数据,提供变异功能性影响、基因定位及已知突变匹配的内容。
26. 配备荧光计,用于测序质控,至少满足测量范围 300-1000 nm ,处理时间:≤ 5 秒 / 样品。
27. 配备磁力架,用于磁珠纯化等过程,至少满足 16 个标准孔位。
28. 配备振荡器及微型离心机,用于测序样品前处理。振荡器至少满足振动与旋涡混合方式,转速≥ 2800 转 / 分,微型离心机至少满足 1.5/2mL 离心管的沉淀或离心,转速≥ 10000 转 / 分。
( 三 ) 配置
1. 基因测序仪 1 台
2. 自动化样本制备系统 1 台
3. 本地化服务器 1 台
4. 微生物快速识别软件 1 套
5. 微生物组装溯源软件 1 套
6. 新冠病毒分析软件 1 套
7. 遗传病测序和肿瘤测序分析软件 1 套
8. 荧光计 1 台
9. 测试荧光计所需试剂 1 套
10. 磁力架 1 套
11. 振荡器 1 台
12. 微型离心机 1 台
★ 13. 配备必要测试及培训试剂( 96 人份 / 套)
13.1 开机测试试剂 1 套
13.2 测序技术全流程培训所需新冠检测试剂 3 套,细菌全基因组检测试剂 1 套
需落实的政府采购政策内容:按照落实政策为促进中小企业、促进残疾人就业、支持监狱企业、支持脱贫攻坚、对于节能产品、环境标志产品、对于列入《辽宁省创新产品和服务目录》内的产品、服务等相关政策标准执行。